并通过分享基因数据获取电子货币新葡萄京官网8455,对于DNA公司是否会将你的基因隐私信息分享给别人的担心

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Nebula还与基因组测序和解释公司Veritas遗传学签署了一项协议,将把该公司的市场与Veritas的Arvados开源软件平台连接起来,后者是一个用于存储、共享和分析基因组数据的系统。

早期的基因组学存在一个很大的问题,那就是它们需要存储的数据太大了,每个基因组都包含大约30亿个单词的信息,这让基因数据的分享和下载变得异常之慢。

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“以999美元完成全基因组测序,并通过分享基因数据获取电子货币!”——这是基因测序行业一初创公司的“奇思妙想”,这家公司由哈佛“遗传学大牛”George
Church牵头成立,致力于革新消费级基因测序,让客户能够真正拥有自己的测序数据。

1. 背景介绍

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欧洲生物信息研究所(European Bioinformatics
Institute)的主管伊万·伯尼表示,Nebula所提出的这种“初生牛犊不怕虎”的方案,在欧洲这种民众更愿意向公共机构分享他们个人数据的地方,很难体现出其优势。

“我认为我们所面对的最大的挑战是教育人们,让他们意识到基因数据的巨大价值,”Nebula公司的另一名联合创始人丹尼斯·格里申这样说道。

George Church相信,Nebula
Genomics能够助力疾病解析、改善药物开发,打造价值数十亿美元的基因组数据市场。目前,Nebula
Genomics还未确定电子货币发放的细节以及初始时间。他们预计,未来几个月,该平台将面向消费者。

3. 总结与分析

刚才我们简单介绍了Nebula
Genomics项目,现在我们通过几个问题来思考一下这个项目的合理性和必要性。

1、必须使用区块链吗?如果不使用区块链能否实现?

我认为,Nebula Genomics项目使用区块链的原因有以下几点:

①用户身份隐私保护;②数据传输安全、透明;③智能合约保障交易;④使用token方便用户和机构交易。

我们逐条分析。

第①条,用户身份隐私保护,并不一定需要区块链,只要在整个业务流程里不获取用户的实名信息,通过其他手段来标识用户,也一样能保护其隐私;

第②条,数据传输安全、透明,这一点可能还是需要利用区块链来实现。因为一旦数据到了用户手上,之后的任何传输如果通过中心化的服务,用户是无法确认数据有没有被传到其他地方的。而通过区块链的话,所有的操作都会被记录在链上,如果能保证计算节点的安全性,数据也不会外泄(这块儿对于计算节点与区块链的关系我还是不很清楚,需要后面进一步的学习);

第③条,区块链的智能合约的确可以免除中间商,虽然有公信力的中心化服务也可以作为一个可信任的中介,但利用区块链来免除中介似乎是一个更让人放心的选择;

第④条,使用token支付的确会使得交易更加便捷,最简单的情况就是跨国支付,无需繁杂的货币兑换手续,对于用户来说可以将基因组数据出售给其他国家的药商或研究团队,而研究机构也可以方便的收集全世界的数据。

通过以上分析,我认为该项目与区块链的结合是有必要的,如果不使用区块链,是很难达到其目标的。

2、是否有难以解决的问题?

我认为还是存在一些硬伤的。

第1,Nebula
Genomics可以为用户直接提供测序服务,但将数据传回给用户之前,数据是掌握在他们手里的。这里Nebula
Genomics还是一个中心化的测序机构,如何保证数据的安全性是一个非常重要的问题。Nebula的白皮书里也提到了这个问题,他们提到未来便携式的测序仪可能会改变这一现状。这个问题确实短期内不好解决,但无论如何Nebula
Genomics已经向保护用户隐私的目标迈出了第一步,我们倒是可以暂时选择相信Nebula
Genomics的职业操守。

第2,用户表型数据的真伪。因为药商往往会选择感兴趣的用户来购买他们的基因组数据或者为他们测序买单,这就会使得用户来伪造其表型数据,比如有的正常人会说自己是某种疾病的患者,来提高被药商买单的几率。针对这一问题,我也咨询了Nebula的相关开发人员。他们的答复是,可以设计出复杂的、无法被猜到目的的调查问卷,使得用户无法知道药商感兴趣的是哪种疾病。他们还说,对于科学研究来说,正常样本也同样重要。我理解他们的意思,但对于这个问题我还是保留我的观点,毕竟各种投机取巧的人无处不在。当然,对于这个问题,后面也可以加入一系列的审查、验证步骤,或者再通过与医院机构合作,统一获取用户的表型数据,类似于微博的认证一样,用户可以对自己的表型数据申请认证,也可以置之不理,选择权则交到了数据购买者手里。


综合以上分析可知,基因组和区块链结合是有一定合理性的,比如数据安全、去除中间机构、智能合约保障等,对于基因测序市场来说是很好的结合和拓展。但是也存在不少亟需解决的问题,比如测序机构数据的安全、表型数据的伪造等。

但是,我们应该看到这类项目的存在意义。往大了说,它们会促进基因组学的研究,促进测序产业的发展,也许未来科学家们会使用区块链上买来的数据来研究出新的药物靶点;同时越来越多的人会参与到测序浪潮中来,从而更好深入的了解自己。往小了说呢,药厂拿数据的成本会降低、流程会变简单,而个人用户也会通过安全的出售自己的基因数据而获取不菲的利益。可见,这类项目如果能发展成功,是对社会具有推动作用的。所以虽然他们会遇到不少的问题,但我还是祝愿它们能披荆斩棘,不断向前!期待在这个技术变革的时代,越来越多的先锋能身先士卒,探索新科技新技术的进化之路,为人类社会进步做出贡献!

据cryptovest报道,专注于DNA数据的区块链项目Nebula
Genomics表示,已从10家风险投资公司筹集430万美元资金,计划“为基因组数据创建一个可信、安全、分散的市场”。

如果有人现在告诉你,某些公司正做着DNA信息共享的生意,售卖着你的个人基因“指南书”,你或许会感到非常得反感,但唯一值得你确幸的是,你并不是唯一一个反感这件事儿的人。

这家基因测序公司是由哈佛医学院的乔治·丘奇教授联合创办的,丘奇教授是一位甘地式的基因测序梦想家。

自2017年FDA批准首个直接面向消费者的基因检测产品之后,科学家们在基因测序上的运作越来越“大胆”、“亲民”。同年,全球测序巨头Illumina子公司Helix开发并上线了首个DNA
APP Store,开创了“网上下单进行全基因组测序”的先河。

2.3 技术实现

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Nebula Genomics 技术架构

上图是Nebula网络的整体结构,隐私保护、身份验证、记录保存、智能合约方面,采用以太坊的区块链网络;数据接入、存储则使用Blockstack。

数据处理方面,Nebula
Genomics首先将基因组数据比对在人类的参考基因组上。由于不同人之间的基因数据的一致性高达99.9%,真正只有0.1%的差别表现出来特征差异,所以不同人之间的数据是包含大量冗余的。于是Nebula
Genomics首先将每个人的差异部分提取出来,并利用这部分数据再网络中传输。具体做法是:通过序列hash来索引参考基因组中的特定段序列,记录该序列某些位置的碱基变化情况,如下图所示。购买者拿到数据以后,则可以通过同一份参考基因组还原完整的基因组信息。未处理的数据一般在150~200G左右,而经过这种处理之后,数据只剩10M左右,这将极大的提高传输效率。

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引入新的数据格式

数据分析方面,Nebula Genomics使用支持Intel
SGX的计算节点进行加密分析。计算节点和用户节点协商好密钥后,计算节点获取到加密后的隐私数据,之后所有的隐私操作将只在SGX的enclave内部进行,外界无法获取,最终将计算结果提供给外部环境;计算节点再将结果加密后传输给数据购买者,详情如下图所示。

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安全计算

另外,Nebula
Genomics引入了同态加密,即通过直接对多个节点的数据密文进行一些统计分析,然后再进入SGX的enclave中对密文分析结果进行处理,这样减少了解密数据的次数,减少了工作量。

限于篇幅,其他技术细节这里不再介绍,感兴趣的读者可阅读Nebula
Genomics白皮书。

目前,该平台拥有超过20
pb的数据,全世界的研究人员和制药公司都在使用这些数据。

然而,一家名为Nebula
Genomics的科技公司认为他们已经想到该问题的解决方案,他们雄心勃勃的提议不仅能让你得到基因测序服务,还能让你从中赚钱,当然,赚钱的前提是你必须同意向研究者或是制药公司,分享你的个人基因信息。

除了贵之外,另一个阻碍他们进行基因检测的因素就是对隐私泄露的担忧。Nebula公司通过调研发现,29%的人会担心他们基因数据的安全性。

2创新之处:电子货币交易基因组数据

我们正在经历变革,浩浩荡荡、难以抗拒的区块链变革。每个国家都在研究如何应对狂热的市场,每个公司都在挖空心思如何涉足其中。2018年,区块链氛围将注定以大火燎原之势在人类社会蔓延开来。

除了贵之外,另一个阻碍他们进行基因检测的因素就是对隐私泄露的担忧。Nebula公司通过调研发现,29%的人会担心他们基因数据的安全性。

虽然Nebula并未向我们详细透露其客户所得到的补贴的具体金额,但他们指出,这个服务于大型制药公司的基因数据市场的市场规模,目前已经达到十亿美元级别了。

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1.2 如何获取基因组数据

现如今,想要获取基因组数据,对于个人来说还是比较难的。虽然市场上已经出现了便携式测序仪,但还在发展中且并未普及。所以这些工作都应该交给专业的实验室或者公司才行,他们会对你的样本(比如唾液、血液等)进行处理,并利用测序仪来测定你的基因组序列,最后再对数据进行深度分析。他们一般会使用
Illumina
或其他公司的测序仪进行测序,会产生数十G至上百G的数据。一个人的基因序列文件也就几个G大小,但因为测序仪需要通过大量的错位重叠来保证数据的正确性,所以实际得到的数据量非常大。

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Illumina 测序仪

当然以上说的都是全基因组测序的数据,就是把所有基因的位点都给测了。基因组上的位点并不是全都重要,至少现在研究出来的重要基因位点少之又少。所以能不能想办法只测这些重要位点的数据?当然可以!比如使用基因芯片筛查,23andme
公司就是使用的这种技术,来检测用户的重要基因位点是否有改变,从而给出一些祖源分析、健康风险等等的报告。那是不是说,可以使用基因芯片取代全基因组测序了?完全不是!基因芯片仅仅靶向一小部分位点的改变,而全基因组测序拿到的是完整的基因组数据,对于科学研究来说,不考虑成本的情况下当然是获取全基因组测序数据了。

成本方面,全基因组测序需要花费600-10000美元,无论对于个人还是研究组织,都是相当昂贵,而基因芯片只需要100-500美元(参考自zenome白皮书)。降低测序成本看起来是迫切需要的,因为这样不仅能使得更多的人愿意参与到测序生态中来,也会让科学家拥有更多的数据来进行分析研究,从而了解更多的疾病机制机理。

除此之外,基因组学还有望改善发展中国家的公共医疗水平,让医疗工作者们能更好地理解并治疗那些传染性疾病,阻止疫情的蔓延。

伯尼还表示:“因为不同国家的医疗保健服务太不一样了,所以你无法保证同样一套方案能适应于所有国家。Nebula所提出的这套方案是很美式的,它没有所谓的对与错,因为只有美国人会这么干。”

Nebula
Genomics白皮书(图片来源:

2.1 动机

Nebula Genomics发起该项目的动机主要有以下几点:

    ①基因测序市场潜力较大,目前绝大多数人没有测过自己的基因组,目前进入这一市场将抢占先机。

    ②现有的基因测序公司(如23andMe)会出售用户的基因组数据给第三方机构,用户无法掌控自己的基因组,Nebula
Genomics希望通过区块链来实现用户对自身数据的绝对控制。

    ③对于用户来说,获取自己的完整基因组的价格较高,Nebula
Genomics通过帮助用户出售数据来降低其成本。

    ④对于研究机构来说,迫切需要获得大量高质量、标准化的基因组数据来推动药物研发和科研工作,Nebula
Genomics计划通过自己提供测序来实现数据的标准化,以此更好地服务研究机构。

针对以上动机,Nebula
Genomics计划通过提供完整的一套流程来介入市场,从最开始的基因测序到数据售卖再到数据分析,全部由其提供,当然也允许各个阶段第三方资源的引入。

Nebula的商业模式,即让科研人员们来补贴人们进行基因测序的做法,“终将吸引到许多目前基因组数据还未被充分呈现的团体,”欧巴德教授这样补充说道。

在英国伦敦大学学院癌症研究所研究药物基因组学的斯蒂芬·贝克教授表示,在今年二月份的时候,当Nebula公司公开宣称自己能够解决这些问题时,它很快就引起了许多人的兴趣。

现在,Nebula
Genomics公司旨在真正实现数据库的“电子交易”。“让普通人将基因数据‘货币化’。”
联合创始人之一Kamal
Obbad博士表示,“与23andMe和Ancestry.com类似,Nebula也会为用户提供疾病风险的信息。”

注明:考虑到各个领域的读者知识结构不同,我尽量用最简洁的话介绍所涉及到的东西,但不免会增加文章篇幅,使其变得冗长;另外本人水平有限,文章中不免会出现各种错误和理解不到位的地方,还望大家多多批评指正。

Nebula称他们的模型将拓宽科学家们从事研究的基因组学池子,使研究的范围不仅仅只局限于那些富裕的美国人和欧洲人。

如果有人现在告诉你,某些公司正做着DNA信息共享的生意,售卖着你的个人基因“指南书”,你或许会感到非常得反感,但唯一值得你确幸的是,你并不是唯一一个反感这件事儿的人。

Nebula
Genomics发布白皮书表明,生物技术和制药公司事实上无法下载所有用户的数据,只是借用一下。数据所有者将得到隐私保护,而买家必须完全透明化自己的身份。基因组数据和交易记录都将得到区块链保护。

1.背景介绍

         1.1什么是基因组

         1.2如何获取基因组数据

         1.3什么是区块链

         1.4基因组+区块链的项目总览

  1. Nebula Genomics 项目概览

         2.1动机

         2.2关键卖点

         2.3技术实现

  1. 分析与总结

15年前,多国学者通力合作,历经十几年,花费将近30亿美元,才首次完成了对人类全基因组的测序。然而,随着关键技术的逐一突破,目前基因检测的时间已被大幅缩短,其费用也直线降至了大约1000美元。

除此之外,基因组学还有望改善发展中国家的公共医疗水平,让医疗工作者们能更好地理解并治疗那些传染性疾病,阻止疫情的蔓延。

Nebula
Genomics的创新之处在于:为用户提供价格低于1000美元的基因组测序服务,而客户可以运用加密电子货币交易自己的基因数据!

1.1 什么是基因组

引自维基百科:

在生物学中,一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA(部分病毒是RNA)中的全部遗传信息,又称基因体(genome)。

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基因组

通俗来讲,一个人的基因组就是一套字母序列(ATGC),不同的字母组合编码着不同的特性(不同外貌、健康状况等)。这些序列在人的细胞中主要以染色体的形式存在,其中一半来自父亲,一半来自母亲,组成了自己的完整基因组,然后再一代一代传下去。

为什么基因组那么重要?不仅仅是因为基因组决定了我们的一切身体特征,包括什么肤色、眼睛多大、基础身高多高等等,还因为它与我们的健康息息相关。这种关联表现在,DNA序列的非正常改变可能会使得人更容易得某种病、或者直接导致某种疾病的发生。而这些序列改变有可能来自于父母的遗传,也有可能是受到环境影响(如吸烟、辐射等)造成。

在生命科学领域,基因组与疾病的关联始终是科学家们研究的热点。他们的研究成果使得临床上可以通过基因组检测来提示风险或确诊疾病。比如唐氏综合征的筛查、单基因遗传病检测、癌症的靶向治疗等等。然而,基因组的研究仍然有很长的路要走,科学家们需要更创新的方法、更多更精确的数据,以及更低的科研成本。

据外媒Telegraph报道,你是否曾经担心过那些科技巨头会利用你的个人信息来赚钱?是否猜测过这些“幕后黑手”的身份?在Facebook数据泄露事件愈演愈烈的背景下,设想一下,如果数据泄露所包含的范围超越了“个人喜好”和所谓的问卷调查结果,而进一步触及到了你最私密的生物特征——你个人基因组的细节——那会是一幅怎样的情景呢?

“我对于数据如果不在公共领域,就必定是处于匿名或是保密状态的观点,保持怀疑。”

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本文的结构:

作为描绘人类基因组序列的一门科学,基因组学被寄予了改进现代医学,提高公众健康水平的厚望,它可以让科学家们准确地诊断出那些少见的病症,更好地理解诸如癌症这类棘手疾病的病理,并有助于医学研究者研发出更好、更具靶向性、副作用更小的新药。

作为描绘人类基因组序列的一门科学,基因组学被寄予了改进现代医学,提高公众健康水平的厚望,它可以让科学家们准确地诊断出那些少见的病症,更好地理解诸如癌症这类棘手疾病的病理,并有助于医学研究者研发出更好、更具靶向性、副作用更小的新药。

1成立初衷:消除“中间商”

蛊惑人心的话不多说,我们直接切入今天的主题:基因组学与区块链的结合现状。可能会有人觉得,基因组+区块链免不了是蹭热点的商业行为,生命科学领域还是应该老老实实去做研究,瞎搭什么车?也许还会有人说,区块链对于基因组研究生态是绝佳的发展机会,千载难逢。那么真相是什么?我们应该支持哪种观点呢?下面请听老土细细道来。

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